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convertgps_cattle

Useful apps for converter livestock GPS data - SUMHAL - EEZ

https://github.com/serpam/convertgps_cattle

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Repository

Useful apps for converter livestock GPS data - SUMHAL - EEZ

Basic Info
  • Host: GitHub
  • Owner: serpam
  • Language: R
  • Default Branch: main
  • Homepage:
  • Size: 328 KB
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README.md

convertGPS_cattle

Una aplicación para el procesamiento y exploración de datos de dispositivos GPS de medición contínua para el ganado

DOI

Este repositorio contiene varios scripts y aplicaciones para manejar y transformar datos de seguimiento de GPS del ganado. Se han desarrollado por el SERPAM Servicio de Evaluación, Restauración y Protección de Agrosistemas Mediterráneos de la Estación Experimental del Zaidin del CSIC (EEZ-CSIC) en el contexto del proyecto SUMHAL, Sustainability for Mediterraean Hospost integrating LifeWatch ERIC.

Utilización

Para utilizar las aplicaciones es necesario el uso de R. Se recomienda utilizar R-Studio. Una vez en R, es necesario descargarte el repositorio, descomprimir el archivo y abrir el proyecto. Para esto último es necesario abrir el archivo convertGPS_cattle.Rproj.

Conversión de archivos

Esta aplicación realiza la conversión de archivos descargados de los dispositivos GPS de medición contínua en un formato adecuado para su tratamiento.

¿Cómo ejecutarla?

  1. En Local. Para ejecutar la aplicación puedes abrir el archivo scripts/run_convertidor.R y ejecutarlo. O ejecutar en la consola:

r source("scripts/run_convertidor.R")

  1. Online. Esta aplicación también puedes ejecutarla aquí

Combinar y explorar archivos de dispositivos GPS

Esta aplicación permite realizar varias operaciones sobre los archivos de los dispositivos GPS. En concreto:

  • Combinar varios archivos para su descarga como csv
  • Explorar fecha de incio, fin, número de registros, etc.
  • Explorar gráficamente la cantidad de registros para cada una de las fechas.

¿Cómo ejecutarla?

  1. En Local. Para ejecutar la aplicación puedes abrir el archivo scripts/run_combina.R y ejecutarlo. O también puedes ejecutar en la consola:

r source("scripts/run_combina.R")

  1. Online. Esta aplicación también puedes ejecutarla aquí

Versión

Estas aplicaciones están en desarrollo, para cualquier duda, sugerencia o mejora, puedes abrir un issue, o contactarnos directamente.

  • v.1.0

Autores 1

  • Antonio J. Pérez-Luque ORCID logo: Conceptualization, Data curation, Methodology, Software, Validation, Visualization

  • Mauro J. Tognetti Barbieri: Data curation, Methodology, Validation, and Visualization.

  • Maria Eugenia Ramos Font ORCID logo:: Funding acquisition and Resources.

  • Ana Belén Robles Cruz: Funding acquisition, Project administration, Resources, and Supervision.

1. (CRedIT Statment)↩

Como citar

Pérez-Luque, A.J.; Tognetti Barbieri, M.J.; Ramos-Font, M.E.; Robles-Cruz, A.B. (2022). convertGPScattle: Una aplicación para el procesamiento y exploración de datos de dispositivos GPS de medición contínua para el ganado. https://github.com/serpam/convertGPScattle. version 1.0. doi: 10.5281/zenodo.7347994

``` @misc{PerezLuque2022, title = {convertGPScattle: Una aplicación para el procesamiento y exploración de datos de dispositivos GPS de medición contínua para el ganado}, author = {Pérez-Luque, Antonio Jesús and Toggnetti Barbieri, Mauro José and Ramos-Font, Maria Eugenia and Robles Cruz, Ana Belén}, year = {2022}, month = {11}, url = {https://github.com/serpam/convertGPScattle}, version = {1.0} doi = {10.5281/zenodo.7347994} }

```

Financiación

Este aplicación se ha desarrollado con financiación del proyecto SUMHAL: SUMHAL, LIFEWATCH-2019-09-CSIC-13, POPE 2014-2020

Owner

  • Name: SERPAM-EEZ
  • Login: serpam
  • Kind: organization
  • Location: Spain

Servicio de Evaluación, Restauración y Protección de Agrosistemas Mediterráneos

Citation (CITATION.cff) 

# This CITATION.cff file was generated with cffinit.
# Visit https://bit.ly/cffinit to generate yours today!

cff-version: 1.2.0
title: >-
  convertGPS_cattle: Una aplicación para el
  procesamiento y exploración de datos de
  dispositivos GPS de medición contínua para el ganado
message: >-
  If you use this software, please cite it using the
  metadata from this file.
type: software
authors:
  - orcid: 'https://orcid.org/0000-0002-1747-0469'
    given-names: Antonio Jesús
    family-names: Pérez-Luque
    email: ajpelu@gmail.com
  - given-names: Mauro José
    family-names: Toggnetti Barbieri
  - given-names: Maria Eugenia
    family-names: Ramos-Font
  - given-names: Ana Belén
    family-names: Robles Cruz
identifiers:
  - type: url
    value: 'https://github.com/serpam/convertGPS_cattle'
repository-code: 'https://github.com/serpam/convertGPS_cattle'
abstract: >-
  Esta aplicación explora y combina archivos de
  dispositivos de seguimiento GPS de ganado de
  medición contínua que registran la posición del
  animal a intervalos de 5 minutos. Estos
  dispositivos se han instalado en animales de
  diferentes ganaderías en espacios naturales
  protegidos de Andalucía, en el marco del proyecto
  SUMHAL (Sustainability for Mediterranean Hotspots
  in Andalusia integrating LifeWatch ERIC)
keywords:
  - GPS
  - data cleaning
  - livestock
license: MIT
version: '1.0'
doi: 10.5281/zenodo.7347994
date-released: '2022-11-20'

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