Recent Releases of covidmx

covidmx - v0.7.8

Updates the 2022 path

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Published by RodrigoZepeda almost 3 years ago

covidmx - v0.7.7

Fixes #15 in CRAN.

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.7.6

Se arregló el Suggests eliminando la parte de tidyverse para cargar más rápido.

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.7.5

covidmx 0.7.5

  • Se arregló #13 permitiendo ahora que los marcados con edad de cero años aparezcan. Los cortes de fecha ahora incluyen el límite inferior.

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.7.4

covidmx 0.7.4

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.7.3

covidmx 0.7.3

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.7.2

Attempt to fix new CRAN version

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.7.1.2000

  • Se agregaron los cambios de CRAN:
    • Quitar los cambios en options
    • Se agregó el value tag en update_covidmx
    • Se agregaron links en DESCRIPTION.
    • Se arregló un error de encoding al leer como tibble.
    • Se arreglaron los dontrun excepto para update_covidmx donde sí es un dontrun.
  • Se agregó la función check_sites para mejorar el funcionamiento en los tests de CRAN.

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.7.1.0000

covidmx 0.7.1.0000

  • Se cambió la base de ejemplo por una más pequeña y con mejor compresión

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.7.0.1000

covidmx 0.7.0.1000

  • Se arreglaron los headings del README.md
  • Se arregló que la función update_covidmx no se exportaba.

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.7.0.0000

  • Se arregló un bug que ocasionaba que cfr y chr regresaran NaN en lugar de NA cuando usabas la opción fill_NA.

  • Se arregló que los casos eran un tibble vacío si no se reportaban casos con esas condiciones a pesar del fill_zeros = TRUE. Por ejemplo esto antes devolvía:

  • Se mejoró la selección de variables automática en plot_covid para evitar que una df_covariate sea tambien una df_variable.

  • Se arregló un bug que impedía la agrupación por otras covariables de cfr y chr.

```{r} datoscovid <- datosabiertos datoscovid <- datoscovid |> casos(tiposector = "DIF", fillzeros = TRUE) datoscovid$casos

ANTES (ERROR)

A tibble: 0 × 5

… with 5 variables: FECHASINTOMAS , ENTIDADUM , n , ENTIDAD_FEDERATIVA ,

ABREVIATURA

ℹ Use colnames() to see all variable names

AHORA

A tibble: 126 × 5

FECHASINTOMAS ENTIDADUM n ENTIDAD_FEDERATIVA ABREVIATURA

1 2021-07-01 00:00:00 02 0 BAJA CALIFORNIA BC

2 2021-07-01 00:00:00 03 0 BAJA CALIFORNIA SUR BS

3 2021-07-02 00:00:00 02 0 BAJA CALIFORNIA BC

4 2021-07-02 00:00:00 03 0 BAJA CALIFORNIA SUR BS

5 2021-07-03 00:00:00 02 0 BAJA CALIFORNIA BC

```

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.6.2.0000

covidmx 0.6.2.0000

  • Se corrigieron los menús de ayuda para ser más informativos.
  • Se agrego la funcion update_covidmx para actualizar desde github.
  • Se cambio el mensaje de inicio.

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - v0.6.0.1000

Now works with windows

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - covidmx_0.6.0.0000

¡Ahora más rápido con duckdb!

Breaking changes

  • Se eliminó MariaDB y ahora se utiliza duckdb.
  • Se eliminó el requerimiento de instalar herramientas para abrir el zip.
  • Se eliminó la dependencia de glue y se agregó una de cli.

Other changes

  • Se eliminó un bug que requería ggformula para cualquier gráfica
  • Se redujeron las dependencias totales.

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Published by RodrigoZepeda over 3 years ago

covidmx - covidmx_0.5.0.0000

covidmx 0.5.0.0000

  • Se agregó la nueva variable driver a las conexiones a MariaDB para permitir otro tipo de SQL.
  • Se agregó la variable sqlimport para que eventualmente se pueda cambiar mysqlimport a mariadb-import por el cambio en MariaDB acá.
  • Se arregló un error donde no se asignaba bien el cache del diccionario.
  • Se arregló el bug que no eliminaba la descarga en csv si ésta se parseaba en tibble.
  • Se arregló el bug que impedía seleccionar solo Antígeno como pruebas en numero_pruebas
  • Se arregló el bug que impedía seleccionar solo Antígeno como pruebas en positividad
  • Se arregló el bug que impedía seleccionar Defuncón como fecha_tipo en numero_pruebas
  • Se agregó la opción de quiet a positividad
  • Se arregló bug que al filtrar por IMSS devolvía IMSS-BIENESTAR en tipo_sector
  • Se arregló bug que al filtrar por NO devolvía NO ESPECIFICADO en tipo_paciente
  • Se agregaron tests y se conectò a codecov.
  • Se arregló un bug que al filtrar por BAJA CALIFORNIA también devolvía BAJA CALIFORNIA SUR en casos.
  • Se agregó un dataset datosabiertos para poder probar funciones sobre ese data.
  • Se cambió el tutorial a una tabla llamada tblname para que sea más rápido que la descarga y creación del repositorio de Github.
  • Se agregó el parámetro max_date a estima_rt para mejorar la estimación de la ventana de tiempo del RT.
  • Se eliminó que casos por default descargue los datos si no tiene un input o si su input es vacío pues generaba un bug cuando el elemento de la lista no estaba.
  • Se agregó un mensaje onAttach y se eliminaron mensajes al descargar archivos.

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Published by RodrigoZepeda almost 4 years ago

covidmx - covidmx_0.2.0.0000

TL;DR

  • Uso de la librería pins para almacenar los datos en cache.
  • Estudio de caso para Ciudad de México.
  • Descarga robusta de datos: si no puede descargar utiliza los que tiene en memoria.
  • Se mejoró el proceso de identificación de variantes pasándolas por pango.

Breaking changes

  • Las funciones read_datos_abiertos y descarga_datos_abiertos cambiaron sus argumentos.
  • El rt se cambió a estima_rt para no chocar con la t de Student.

New features

  • Las descargas se almacenan en cache usando pins lo cual optimiza el tiempo de trabajo

Bug fixes

  • Se corrigió que la base en MariaDB se tuviera que llamar COVID.
  • Se arregló el caso en el que la estimación de positividad sin agrupar por entidad arrojaba error.

- R
Published by RodrigoZepeda almost 4 years ago