Dokumentation

Bundesweiter klinischer Krebsregisterdatensatz - Datenschema und Klassifikationen

Stefan Meisegeier¹, Maren Imhoff¹, Karsten Berg¹, & Klaus Kraywinkel¹

  ¹ Robert Koch-Institut | ZfKD - Zentrum für Krebsregisterdaten

Zitieren
Meisegeier, S., Imhoff, M., Berg, K., & Kraywinkel, K. (2024). Bundesweiter klinischer Krebsregisterdatensatz - Datenschema und Klassifikationen [Data set]. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.10022040

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E-Mail-Adresse für Rückmeldungen: krebsdaten@rki.de

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Zusammenfassung
In diesem Strukturdatensatz werden begleitende Informationen zu Struktur und Klassifikationen des bundesweiten Datensatzes des Zentrums für Krebsregisterdaten (ZfKD) am Robert Koch-Institut sowie Beispieldaten bereitgestellt. Dieser klinische Krebsregisterdatensatz ist nicht öffentlich zugänglich, kann jedoch auf Antrag für wissenschaftliche Forschung bereitgestellt werden. Er enthält Daten zu neu auftretenden Krebsfällen, die von medizinischen Einrichtungen an die Krebsregister der Bundesländer gemeldet und von dort an das ZfKD übermittelt werden. Die Datenerfassung basiert auf dem Bundeskrebsregisterdatengesetz sowie den entsprechenden Landesgesetze.

Inhaltsverzeichnis <!-- TOCSTART: {"headingdepth": 2} --> - Einleitung - Informationen zum Entstehungskontext des ZfKD-Datensatzes - Struktur des bundesweiten klinischen Krebsregisterdatensatzes - Hinweise zur Nachnutzung der Daten <!-- TOC_END -->

Einleitung

Die Krebsregistrierung in Deutschland erfolgt auf der Basis von Landesgesetzen. Diese verpflichten medizinische Einrichtungen (v. a. niedergelassene Ärztinnen und Ärzte, pathologische Institute, Kliniken, Screening-Einheiten), neu auftretende Krebsfälle und definierte Ereignisse im Krankheits- bzw. Behandlungsverlauf an das zuständige Krebsregister zu melden.

Die Krebsregister der Bundesländer wiederum übermitteln nach Vorgabe des Bundeskrebsregisterdatengesetzes (BKRG) einmal jährlich Angaben zu neu erfassten Erkrankungsfällen an das Zentrum für Krebsregisterdaten (ZfKD) am Robert Koch-Institut. Das ZfKD prüft die Qualität der Daten, führt sie zu einem bundesweiten Datensatz zusammen und stellt sie auf Antrag für wissenschaftliche Forschungsprojekte zur Verfügung.

In diesem Repository werden begleitende Informationen zu Struktur und Klassifikationen des bundesweiten ZfKD-Datensatzes bereitgestellt.

Die hier verwendeten Klassifikationen spiegeln den derzeitigen Arbeitsstand des ZfKD wider. Ein wesentliches Ziel des Repositories ist es, diesen Stand möglichst transparent abzubilden und beteiligte Akteure zur weiteren gemeinsamen Harmonisierung von Standards einzuladen.

💡 Der ZfKD-Datensatz ist nicht öffentlich zugänglich, kann aber auf Antrag für wissenschaftliche Forschungszwecke genutzt werden. Bitte verwenden Sie für Fragen zur Antragstellung die oben genannte E-Mail-Adresse oder das auf der Internetseite des ZfKD bereitgestellte Kontaktformular. Informationen zum gesetzlichen Auftrag, zu Methoden und Veröffentlichungen des ZfKD erhalten Sie ebenfalls auf den Internetseiten des ZfKD. Bitte beachten Sie, dass das ZfKD an den Daten, die von den Krebsregistern übermittelt wurden, keine Änderungen vornimmt.

Informationen zum Entstehungskontext des ZfKD-Datensatzes

Für die Erhebung klinischer Krebsregisterdaten wurde mit dem Krebsfrüherkennungs- und -registergesetz (KFRG) im § 65c Fünftes Buch Sozialgesetzbuch (SGB V) ein bundesrechtlicher Rahmen geschaffen. Die von den klinischen Krebsregistern zu erfassenden Angaben werden in dem von der Arbeitsgemeinschaft Deutscher Tumorzentren (ADT) und der Gesellschaft der epidemiologischen Krebsregister in Deutschland (GEKID) erarbeiteten onkologischen Basisdatensatz (oBDS) spezifiziert und regelmäßig überarbeitet. Die letzte Anpassung des oBDS wurde am 12. Juli 2021 im Bundesanzeiger publiziert. Einmal jährlich übermitteln die Krebsregister Daten nach Maßgabe des Bundeskrebsregisterdatengesetzes (BKRG) an das ZfKD.

Seit der Novellierung des BKRG durch das Gesetz zur Zusammenführung von Krebsregisterdaten enthalten die ans ZfKD übermittelten Daten auch klinische Angaben, u. a. zum Krankheitsverlauf und zur Behandlung (ab Diagnosejahr 2020).

Die Inhalte und die Struktur der ans ZfKD zu übermittelnden Daten wurden in einer AG mit Vertretern des ZfKD und der Krebsregister abgestimmt, dabei diente der oBDS und das novellierte Bundeskrebsregisterdatengesetz (§5) als Arbeitsgrundlage.

Das Arbeitsergebnis ist das hier beschriebene, für die Datenübermittlung ans ZfKD zu verwendende XML-Schema (alternativ als oBDS-RKI oder ZfKD-Lieferdatensatz bezeichnet, siehe dazu Struktur des bundesweiten klinischen Krebsregisterdatensatzes).

Umfassende Informationen zur Krebsregistrierung sind hier verfügbar: Manual der klinischen und epidemiologischen Krebsregistrierung (Veröffentlichung 2019)

Administrative und organisatorische Angaben

Das Zentrum für Krebsregisterdaten (ZfKD) des RKI ist zuständig für die bundesweite Krebsberichterstattung und stellt Dritten auf Antrag Daten für überregionale Forschungsprojekte zur Verfügung. Es prüft die Qualität der von den Krebsregistern übermittelten Daten und gibt den Krebsregistern diesbezüglich Rückmeldung.

Inhaltliche Fragen zur Datenerhebung, Datenauswertung und Datenkuration können direkt an das ZfKD gestellt werden (E-Mail-Adresse für Anfragen: krebsdaten@rki.de).

Datenübermittlung an das ZfKD

Das 2009 verabschiedete BKRG regelt die jährliche Zusammenführung der wesentlichen Daten aus den Krebsregistern am ZfKD. Die Übermittlung erfolgt jeweils am Jahresende und enthält Informationen zu allen Fällen, die bis zum Ende des vorherigen Kalenderjahres diagnostiziert wurden, so dass auch Nachmeldungen und Korrekturen sowie Informationen zum Follow-up (z. B. Sterbefälle und Wegzüge) früherer Erkrankungsfälle enthalten sind.

Vor der Novellierung des BKRG in 2021 wurde lediglich der deutlich kleinere epidemiologische Datensatz (mit Angaben zur Diagnose und zum Sterbezeitpunkt) an das ZfKD übermittelt. Dieser Datensatz wird bundesweit seit 2009 erfasst. Die Mehrzahl der Bundesländer hat zwischen 1998 und 2007 mit der landesweiten Erfassung begonnen.

Seit der Datenlieferung zum 31. Dezember 2022 und rückwirkend ab dem Diagnosejahr 2020 liefern die Krebsregister auch klinische Angaben. Die am ZfKD vorliegenden Daten enthalten allerdings nicht den gesamten Datenbestand der Register, beispielsweise sind keine Angaben zu den behandelnden Einrichtungen verfügbar.

Außerdem sind die Daten in den Krebsregistern bearbeitet worden: So wurden Meldungen aus verschiedenen Quellen zum gleichen Erkrankungsfall zusammengeführt und weitgehend um Widersprüche bereinigt („best-of“). Der Datensatz des ZfKD ist daher fall- und nicht meldungsbasiert, mehrere Tumorerkrankungen derselben Person können anhand einer von den Registern einmal vergebenen Personidentifikationsnummer zugeordnet werden. Die Übermittlung der Daten an das ZfKD erfolgt nach dem Wohnortprinzip (zum Zeitpunkt der Diagnose), so dass Doppelmeldungen weitgehend ausgeschlossen sind. Zwischen den Bundesländern erfolgt ein regelmäßiger Austausch von Daten, die außerhalb des Wohnortbundeslandes der Erkrankten erhoben und zunächst an das Krebsregister des Behandlungsortes gemeldet wurden.

💡 Eine fallweise Verknüpfung (Record Linkage) der am ZfKD vorliegenden Daten mit externen Datensätzen (Studien, Krankenkassen) ist nicht möglich.

Struktur des bundesweiten klinischen Krebsregisterdatensatzes

Der klinische Datensatz wird als oBDS-RKI bezeichnet. Die Bezeichnung geht zurück auf den zwischen ADT, GEKID und Plattform § 65c abgestimmten einheitlichen onkologischen Basisdatensatz (oBDS), der für die Entwicklung des oBDS-RKI als Vorlage und Arbeitsgrundlage diente (siehe Informationen zum Datensatz und Entstehungskontext).

Weil er die Struktur und Inhalte der von den Landeskrebsregistern ans ZfKD zu liefernden Daten definiert, wird der oBDS-RKI auch als ZfKD-Lieferdatensatz bezeichnet.

Zur Veranschaulichung der Datenstruktur werden zufällig generierte Beispieldaten bereitgestellt.

Folgende Informationen sind enthalten:

• Datenschema des Datensatzes in verschieden Formaten
• Klassifikationen: Referenztabellen für Variablen des Datensatzes und ihre definierten Ausprägungen
• Beispieldaten: zur Veranschaulichung des Bereitstellungsprozesses der Daten

Datenschema

Das Datenschema umfasst mehr als 120 Variablen, die verschiedenen Elementen zugeordnet sind. Die klinischen Daten können nicht in einer einfachen „Rechtecktabelle“ wiedergegeben werden, da sie zum Teil komplexe Krankheitsverläufe abbilden. Im klinischen Datensatz sind die Daten daher in einem verschachtelten XML-Schema strukturiert.

Der klinische Datensatz wird durch folgende Elemente gegliedert:

• Die Person bildet die grundlegende Einheit im Datensatz.
• Der Person zugeordnet ist mindestens ein Element Tumor.
• Das Element Tumor enthält ein verpflichtendes Element Primärdiagnose. Dieses enthält u. a. Angaben zum Tumorstadium, zur Histologie und Lokalisation des Tumors.
• Darüber hinaus sind dem Element Tumor mehrere optionale Elemente zugeordnet, in denen Angaben zur Behandlung (Elemente OP, ST und SYST) und zu Folgeereignissen (Element Folgeereignis) wie Remissionen und Rezidiven erfasst werden können.

Bestimmte Variablen sind Pflichtangaben, z. B. das Geburtsdatum, der Inzidenzort und der Diagnoseschlüssel. Viele Angaben sind optional, z. B. die den Elementen cTNM und pTNM zugeordneten Variablen (T-Kategorie, UICC-Stadium, m-Suffix usw.). Einige Angaben sind nur unter der Bedingung verpflichtend, dass das übergeordnete, optionale Element verwendet wird: Beispielsweise ist das Element Histologie optional. Wird jedoch in der zugehörigen Variable Morphologie ein Eintrag vorgenommen, ist auch eine Angabe zum Grading verpflichtend. Angaben zur Zahl untersuchter Lymphknoten bleiben optional.

Bei Auswertungen ist zu beachten, dass optionale Inhalte möglicherweise nicht gleichermaßen aus allen Bundesländern vorliegen.

Die Elemente Primärdiagnose, Folgeereignis, OP, ST und SYST können mehrfach verwendet werden, so dass auch komplexe Krankheitsverläufe abgebildet werden können. Die Inhalte eines Elements können in ein tabellarisches Format überführt und über eine fallbezogene Nummer mit anderen Tabellen aus dem Datensatz verknüpft werden. Auf diese Weise entsteht ein auswertbares Format, in dem die bewilligten Daten an den Datenempfänger übermittelt werden können (siehe Beispieldaten).

Protokollierte Änderungen am Datenschema sind in den beigefügten Release Notes der Versionen zu finden.

Abbildung: Vereinfachtes Datenschema (mit ausgewählten Variablen). Quelle: krebsdaten.de.

Downloads

Das Datenschema wird in verschiedenen Formaten zum Download angeboten:

| Datei | Beschreibung | Download | | ----- | ------------ | -------- | | XML-Schema | Die XML-Schema-Definition .xsd als eindeutige, vollständige und maschinenlesbare Repräsentation des gesamten Schemas mit allen Details. | 💾 | | XLSX-Schema | Variablen und mögliche Ausprägungen in tabellarischer Darstellung als .xlsx. | 💾 | | TXT-Schema | Variablen und mögliche Ausprägungen in stark vereinfachter textueller Darstellung zur erleichterten Erkennung von Änderungen. | 💾 | | PDF-Schema (Abbildung) | Die grafische Darstellung des XML-Schemas als .pdf. Aufgrund der Komplexität des Gesamtschemas sind nicht alle Elemente abgebildet. Hinweise zur Notation des XML-Schemas sind hier zu finden. | 💾 | | PDF-Schema (Liste) | Optisch gestaltete und "druckerfreundliche" Kurzübersicht zu Variablen und möglichen Ausprägungen als .pdf. | 💾 |

XML-Schema des Datensatzes

Eine vollständige und maschinenlesbare Repräsentation des gesamten Datenschemas mit allen Details ist wird über das XML-Schema bereitgestellt.

XML (Extensible Markup Language)-Schemata definieren den erlaubten Aufbau der ihnen zugeordneten XML-Dokumente. XML ist eine Auszeichnungssprache mit definierter Struktur und Syntax. XML-Dokumente sind textbasiert und repräsentieren Daten in einer hierarchischen und strukturierten Weise. Der Hauptzweck von XML besteht darin, Daten so zu beschreiben, dass sie sowohl für Menschen als auch für Maschinen leicht verständlich und interpretierbar sind.

Ein XML-Schema, oft auch als XSD (XML Schema Definition) bezeichnet, bietet einen Rahmen zur Beschreibung der Struktur und Datentypen eines XML-Dokuments. XML-Schemata legen fest, welche Elemente und Attribute in einem XML-Dokument erscheinen können, wie diese strukturiert und organisiert sind und welche Datentypen sie enthalten können. XML-Schemata können dazu verwendet werden, um XML-Dokumente zu validieren. Hierbei wird überprüft, ob ein XML-Dokument der im Schema definierten Struktur entspricht.

Detaillierte technische Informationen zum abgestimmten XML-Schema sind auf der Internetseite der Plattform § 65c abrufbar (bis Version 3.0.0.8_RKI).

Abbildung: Übersicht zum XML-Schema des klinischen Datensatzes. Quelle: eigene Darstellung.

Klassifikationen

Die für einzelne Variablen erwarteten Ausprägungen und ihre Beschreibung sind in Referenztabellen hinterlegt. Einzelne Referenzen werden für mehrere Variablen genutzt: Beispielsweise wird für den Östrogen-Rezeptorstatus und den Progesteron-Rezeptorstatus die gleiche Kodierung verwendet. Ebenso werden für die Angaben zur klinischen und pathologischen TNM die gleichen Referenztabellen genutzt.

Größtenteils handelt es sich bei den Referenzen um Vereinbarungen, die bei der Erarbeitung des ZfKD-Lieferdatensatzes getroffen wurden (z. B. Ausprägungen von Variablen im Element Strahlentherapie, Ausprägungen von Diagnosesicherung). Teilweise handelt es sich bei den Referenzen um internationale oder nationale Standards (z. B. TNM, ATC-Klassifikation für den deutschen Arzneimittelmarkt). Informationen zu Quelle und Version der jeweiligen Referenzwerte, zu ihrer Interpretation und zu gegebenenfalls bestehenden Nutzungsbedingungen der Herausgeber sind im Abschnitt Ergänzungen zu den Referenztabellen zusammengestellt.

💡 Einige Referenztabellen geben Inhalte von Standards wieder, die von Dritten herausgegeben werden. Unter Umständen verbinden diese Anbieter die Nutzung ihrer Produkte mit Bedingungen. Die Nutzungsbedingungen sind an den jeweils zutreffenden Stellen verlinkt. Wir bitten Sie diese zu beachten.

Referenztabellen

In der folgenden Übersicht sind die verwendeten Referenztabellen aufgeführt. Die Tabellen bilden den Wertebereich aller kodierten Variablen als Klassifikationen ab.

Bedeutung der Spalten:

• Klassifikation ausformulierte Bezeichnung der Klassifikation
• Element technische Variablenbezeichnung Elternknoten im XML-Schema sowie der technische Name der entsprechenden Variable. Dieser Name wird u.a. auch im exportierten Datensatz verwendet.
• Datei Name der Klassifikationsdatei

| Klassifikation | Element technische Variablenbezeichnung | Datei | | -------------- | ------------------------------------------- | ----- | | Angabe zur perkutanen Strahlentherapie |Strahlentherapie Atemgetriggert | atemgetriggert.csv | | Folgeereignis - Gesamtbeurteilung Tumorstatus |Folgeereignis Gesamtbeurteilung_Tumorstatus | beurteilung_gesamt.csv | | Folgeereignis - Beurteilung Primärtumor |Folgeereignis Verlauf_Lokaler_Tumorstatus | beurteilung_lokal.csv | | Wertigkeit der Diagnosesicherung |Primärdiagnose Diagnosesicherung | diagnosesicherung.csv | | DCN (death certificate notified) |Primärdiagnose DCN | dcn.csv | | Lokalisation der Fernmetastasen |Primärdiagnose Lokalisation, Folgeereignis Lokalisation | fm_lokalisation.csv | | Geschlecht |Person Geschlecht | geschlecht.csv | | Modul Prostata: Anlass der Probenahme |Primärdiagnose AnlassGleasonScore | gleason_anlass.csv | | Modul Prostata: Gleason-Score |Primärdiagnose ScoreErgebnis | gleason_score.csv | | Differenzierungsgrad |Primärdiagnose Grading | grading.csv | | Modul Mamma: Her2neu Status |Primärdiagnose Her2NeuStatus | her2neu.csv | | Modul Mamma: Hormonrezeptorstatus |Primärdiagnose HormonrezeptorStatus_Oestrogen, Primärdiagnose HormonrezeptorStatus_Progesteron | hormonrezeptor.csv | | Todesursache, Grundleiden nach ICD-10 |Todesursachen Code | icd10_todesursache.csv | | Ausgabe der ICD-10 |Todesursachen Version, Primärdiagnose Diagnose_ICD10_Version | icd10_version.csv | | Diagnose nach ICD-10 |Primärdiagnose Diagnose_ICD10_Code | icd10.csv | | Angabe zur Kontaktbestrahlung |Strahlentherapie Interstitiell_endokavitaer | interstitiell.csv | | Wohnort bei Diagnose |Primärdiagnose Inzidenzort | landkreis.csv | | Modul Mamma: Menopausenstatus |Primärdiagnose Praetherapeutischer_Menopausenstatus | menopausenstatus.csv | | Typ der metabolischen Strahlentherapie |Strahlentherapie Metabolisch_Typ | metabolisch.csv | | Quelle Morphologie |Primärdiagnose Morphologie_Version | morphologie_version.csv | | Morphologie |Primärdiagnose Morphologie_Code | morphologie.csv | | Intention der OP |Operation Intention | op_intention.csv | | Operationen- und Prozedurenschlüssel (OPS) |Operation Code | ops.csv | | Therapieprotokoll |Systemische Therapie Protokoll_TypProtokollschluessel_Code | protokoll.csv | | Ausführung der perkutanen Radiochemotherapie |Strahlentherapie Radiochemo | radiochemo.csv | | Modul Darm: Mutation K-ras-Onkogen |Primärdiagnose RASMutation | rasmutation.csv | | Dosisleistung Kontaktbestrahlung |Strahlentherapie Rate_Type | rate_type.csv | | Körperseite der bestrahlten Region |Strahlentherapie Seite_Zielgebiet | seite_zielgebiet.csv | | Seitenlokalisation bei paarigen Organen |Primärdiagnose Seitenlokalisation | seitenlokalisation.csv | | Intention der Strahlentherapie |Strahlentherapie Intention | st_intention.csv | | Bezug Strahlentherapie - OP |Strahlentherapie Stellung_OP | stopstellung.csv | | Angabe zur perkutanen Strahlentherapie |Strahlentherapie Stereotaktisch | stereotaktisch.csv | | Verwendete Substanzen |Systemische Therapie TypeOfSYST_TypSubstanz | substanz.csv | | Intention der systemischen Therapie |Systemische Therapie Intention | syst_intention.csv | | Bezug systemische Therapie - OP |Systemische Therapie Stellung_OP | systopstellung.csv | | Art der systemischen Therapie |Systemische Therapie Therapieart | therapieart.csv | | TNM-Ausgabe |Primärdiagnose TNM_Auflage_c, Primärdiagnose TNM_Auflage_p, Folgeereignis Version | tnm_auflage.csv | | TNM-Präfix (c, p, u) |Primärdiagnose c_p_u_Praefix_T_c, Primärdiagnose c_p_u_Praefix_N_c, Primärdiagnose c_p_u_Praefix_M_c, Primärdiagnose c_p_u_Praefix_T_p, Primärdiagnose c_p_u_Praefix_N_p, Primärdiagnose c_p_u_Praefix_M_p, Folgeereignis c_p_u_Praefix_T, Folgeereignis c_p_u_Praefix_N, Folgeereignis c_p_u_Praefix_M | tnm_cpu.csv | | TNM: Lymphgefäßinvasion |Primärdiagnose cTNM L_p, Primärdiagnose pTNM L_p, Folgeereignis L | tnm_l.csv | | TNM: Fernmetastasierung |Primärdiagnose cTNM M_c, Primärdiagnose pTNM M_p, Folgeereignis M | tnm_m.csv | | TNM: Regionäre Lymphknotenmetastasierung |Primärdiagnose cTNM N_c, Primärdiagnose pTNM N_p, Folgeereignis N | tnm_n.csv | | TNM: Perineuralinvasion |Primärdiagnose cTNM Pn_c, Primärdiagnose pTNM Pn_p, Folgeereignis Pn | tnm_pn.csv | | TNM: Serumtumormarker |Primärdiagnose cTNM S_c, Primärdiagnose pTNM S_p, Folgeereignis S | tnm_s.csv | | TNM: Ausdehnung des Primärtumors |Primärdiagnose cTNM T_c, Primärdiagnose pTNM T_p, Folgeereignis T | tnm_t.csv | | TNM: UICC-Stadium |Primärdiagnose cTNM UICC_Stadium_c, Primärdiagnose pTNM UICC_Stadium_p, Folgeereignis UICC_Stadium | tnm_uicc.csv | | TNM: Veneninvasion |Primärdiagnose cTNM V_c, Primärdiagnose pTNM V_p, Folgeereignis V | tnm_v.csv | | Ausgabe der ICD-O |Primärdiagnose Topographie_Version | topographie_version.csv | | ICD-O Topographie |Primärdiagnose Topographie_Code | topographie.csv | | Verlauf: Fernmetastasierung |Folgeereignis Verlauf_Tumorstatus_Fernmetastasen | verlauf_fern.csv | | Verlauf: Lokaler Tumorstatus |Folgeereignis Verlauf_Lokaler_Tumorstatus | verlauf_lokal.csv | | Verlauf: Regionärer Lymphknotenstatus |Folgeereignis Verlauf_Tumorstatus_Lymphknoten | verlauf_lymphe.csv | | Zielgebiet Strahlentherapie oBDS2014 |Strahlentherapie Perkutan CodeVersion2014, Strahlentherapie Kontakt CodeVersion2014, Strahlentherapie Metabolisch CodeVersion2014, Strahlentherapie Sonstige CodeVersion2014, Strahlentherapie Unbekannt CodeVersion2014 | zielgebiet_2014.csv | | Zielgebiet Strahlentherapie oBDS2021 |Strahlentherapie Perkutan CodeVersion2021, Strahlentherapie Kontakt CodeVersion2021, Strahlentherapie Metabolisch CodeVersion2021, Strahlentherapie Sonstige CodeVersion2021, Strahlentherapie Unbekannt CodeVersion2021 | zielgebiet_2021.csv |

Datumsangaben

Die Angabe Tag wird von den Registern grundsätzlich nicht ans ZfKD übermittelt. Das ZfKD legt den Tag auf einen beliebigen Wert fest (i. d. R. 15), so dass immer ein Datum im Format Jahr-Monat-Tag vorliegt. Für jede Datumsangabe im Datensatz liegen jeweils zwei Variablen vor:

• das Datum im internationalen Datumsformat (ISO 8601) yyyy-mm-dd und
• die Genauigkeit des Datums in einer von drei möglichen Ausprägungen (M, T, V): M = nur das Jahr ist bekannt (jahrgenau) T = Jahr und Monat sind bekannt (monatsgenau) V = Jahr und Monat wurden geschätzt

Ergänzungen zu den Referenztabellen

In diesem Abschnitt werden ergänzende Informationen zu den Inhalten der Referenztabellen bereitgestellt.

Diagnose nach ICD-10

Die Erstellung der Referenztabelle erfolgte unter Verwendung der maschinenlesbaren Fassung der ICD-10-GM (Version 2008) des Bundesinstituts für Arzneimittel und Medizinprodukte (BfArM), unter Verwendung der Empfehlungen des GKV-Spitzenverbands für die klinische Krebsregistrierung (Stand: 14.05.2020) und unter Verwendung des Umsetzungsleitfadens der Plattform § 65c (Stand: 15.11.2023).
Die Nutzungsbedingungen der ICD-10 des BfArM sind hier hinterlegt.

Klassifikationen/icd10.csv

Variablen und Ausprägungen der Referenztabelle:

| Variable | Typ | Ausprägungen | Beschreibung | | --------- | --- | ------------ | ------------ | | id | String | z. B. C021 | ICD-10-Diagnoseschlüssel, 4-Steller werden ohne Trennzeichen dargestellt | | code | String | z. B. C02.1 | ICD-10-Diagnoseschlüssel, 4-Steller werden mit Trennzeichen dargestellt | | name | String | z. B. Bösartige Neubildung... | Beschreibung der Diagnose | | id3 | String | z. B. C02 | ICD-10-Diagnoseschlüssel, 3-stellig | | epivalide| Boolean | TRUE, FALSE | Information, ob die Diagnose im epidemiologischen Datensatz des ZfKD enthalten ist | | p65valide| Boolean| TRUE, FALSE | Es besteht eine Meldepflicht für den klinischen Datensatz (lt. Plattform § 65c-Umsetzungsleitfaden). |

Todesursache, Grundleiden nach ICD-10

Die Erstellung der Referenztabelle erfolgte unter Verwendung der maschinenlesbaren Fassung der ICD-10-GM (Version 2022) des Bundesinstituts für Arzneimittel und Medizinprodukte (BfArM). Die Nutzungsbedingungen der ICD-10 des BfArM sind hier hinterlegt.

Um die internationale Vergleichbarkeit zu gewährleisten, ist für die Verschlüsselung von Todesursachen die ICD-10-WHO vorgesehen. Aktuell wird bei der Übermittlung von Todesursachen ans ZfKD vorwiegend (noch) die Verwendung der ICD-10-GM angegeben.

Klassifikationen/icd10_todesursache.csv

Variablen und Ausprägungen der Referenztabelle:

| Variable | Typ | Ausprägungen | Beschreibung | | --------- | --- | ------------ | ------------ | | id | String | z. B. C021 | ICD-10-Diagnoseschlüssel, 4-Steller werden ohne Trennzeichen dargestellt | | code | String | z. B. C02.1 | ICD-10-Diagnoseschlüssel, 4-Steller werden mit Trennzeichen dargestellt | | name | String | z. B. Bösartige Neubildung... | Beschreibung der Diagnose | | id3 | String | z. B. C02 | ICD-10-Diagnoseschlüssel, 3-stellig | | chapter | Integer | z. B. 1 | ICD-10-Kapitelnummer |

ICD-O Topographie

Die Erstellung der Referenztabelle erfolgte unter Verwendung der maschinenlesbaren Fassung der ICD-O-3 (2. Revision, Version 2019) des Bundesinstituts für Arzneimittel und Medizinprodukte (BfArM) und unter Zuhilfenahme des Umsetzungsleitfadens der Plattform § 65c (Stand: 15.11.2023). Die Nutzungsbedingungen der ICD-O-3 des BfArM sind hier hinterlegt.

Für paarige Organe (Ausprägung istPaarig = 1, lt. Plattform § 65c-Umsetzungsleitfaden) wird bei der Variable Seitenlokalisation die Angabe der betroffenen Körperseite(n) erwartet.

Klassifikationen/topographie.csv

Variablen und Ausprägungen der Referenztabelle:

| Variable | Typ | Ausprägungen | Beschreibung | | --------- | --- | ------------ | ------------ | | id | String | z. B. C021 | ICD-10 Diagnoseschlüssel, 4-Steller werden ohne Trennzeichen dargestellt | | code | String | z. B. C02.1 | ICD-10 Diagnoseschlüssel, 4-Steller werden mit Trennzeichen dargestellt | | name | String | z. B. Bösartige Neubildung... | Beschreibung der Diagnose | | id3 | String | z. B. C02 | 3-stelliger Diagnoseschlüssel | | istPaarig | Integer | z. B. 1 | 1 = es handelt sich um ein paariges Organ und es wird bei der Variable Seitenlokalisation die Angabe der betroffenen Körperseite(n) erwartet. |

Operationen- und Prozedurenschlüssel (OPS)

Die Erstellung der Referenztabelle erfolgte unter Verwendung der maschinenlesbaren Fassung des Operationen- und Prozedurenschlüssels (OPS) (Version 2022) des Bundesinstituts für Arzneimittel und Medizinprodukte (BfArM). Die Nutzungsbedingungen der Operationen- und Prozedurenschlüssels (OPS) des BfArM hier hinterlegt.

Klassifikationen/ops.csv

Variablen und Ausprägungen der Referenztabelle:

| Variable | Typ | Ausprägungen | Beschreibung | | --------- | --- | ------------ | ------------ | | id | String | z. B. 1-202 | ID, maximal 6-stellig | | chapter | Integer | z. B. 1 | OPS-Kapitel | | group | String | z. B. 1-20 - 1-33 | OPS-Gruppe, -Bereich | | code3 | String | z. B. 1-20 | OPS-Kategorie/-Kode, 3-stellig | | code | String | z. B. 1-202 | OPS-Kategorie/-Kode, 4-stellig | | code5 | String | z. B. 1-202.- | OPS-Kategorie/-Kode, 5-stellig | | code6 | String | z. B. 1-202.-- | OPS-Kategorie/-Kode, 6-stellig | | name | String | z. B. Diagnostik zur Feststellung ... | Klassentitel der Maßnahme |

Substanzen

Die Erstellung der Referenztabelle erfolgte unter Verwendung des Umsetzungsleitfadens der Plattform § 65c in der Version 2021. Die dort hinterlegte Tabelle wurde für unsere Zwecke in folgenden Schritten geringfügig überarbeitet:

• der Eintrag Larotrectinib lag als Duplikat vor, dies wurde korrigiert
• die Spalte Code wurde ergänzt, hier sind gültige ATC-Codes verknüpft, sofern anwendbar
• für die Zuordnung der ATC-Codes wurde auf das Kapitel L beschränkt (Antineoplastic and immunomodulating agents)

Klassifikationen/substanz.csv

Für die Verknüpfung von Substanzbezeichnung und ATC-Code wurde auf die ATC-Klassifikation für den deutschen Arzneimittelmarkt zurückgegriffen:

GKV-Arzneimittelindex im Wissenschaftlichen Institut der AOK (WIdO), AOK Bundesverband GbR Stand 04/2023

Variablen und Ausprägungen der Referenztabelle:

| Variable | Typ | Ausprägungen | Beschreibung | | --------- | --- | ------------ | ------------ | | Therapieart | String | z. B. HO | Art der Therapie | | Substanz| Sting | z. B. Abacavir | Bezeichnung des Arzneimittels | | Code | String | z. B. J05AF06 | ATC-Kode, Ebene 5 |

Therapieprotokoll

Bei der verwendeten Referenztabelle handelt es sich um eine Vorschlagsliste der Plattform § 65c. Diese Vorschlagsliste stellt keine verbindliche Festlegung dar. Ein anerkannter Standard für die Kodierung von Systemtherapie-Protokollen ist uns nicht bekannt. Vorschläge für eine standardisierte Nomenklatur (Rubinstein et al, 2020), Referenzsysteme (HemOnc.org, National Cancer Institute Thesaurus (NCIT)) und kommerzielle Produkte für die medizinische Dokumentation (Onkopti®) wurden von anderen entwickelt. Wir verweisen hier auf eine Auswahl dieser Arbeiten und Systeme.

Rubinstein, S. M., Yang, P. C., Cowan, A. J., & Warner, J. L. (2020). Standardizing Chemotherapy Regimen Nomenclature: A Proposal and Evaluation of the HemOnc and National Cancer Institute Thesaurus Regimen Content. JCO clinical cancer informatics, 4, 60–70. https://doi.org/10.1200/CCI.19.00122
Onkopti® – die Datenbank digitalisierter onkologischer Therapieprotokolle

TNM: Regionäre Lymphknotenmetastasierung

Die Variable beschreibt den Status der regionären Lympknotenmetastasierung (N-Kategorie der TNM).

Klassifikationen/tnm_n.csv

Zusatz (1mi), Mammakarzinom

Anwendung bei: Mikrometastase(n), > 0,2 mm und/oder mehr als 200 Tumorzellen, aber nicht größer als 0,2 cm Stadium IB nach TNM8: T0, T1 N1mi M0

Quellen: Kapitel 11.3, Interdisziplinäre S3-Leitlinie für die Früherkennung, Diagnostik, Therapie und Nachsorge des Mammakarzinoms (2021); TNM Classification of Malignant Tumours, 8th edition

Zusatz (sn)

| Ausprägung | Beschreibung | | ---------- | ------------ | | (p)NX(sn) | Schildwächterlymphknoten kann histologisch nicht beurteilt werden | | (p)N0(sn) | Histologisch keine Lymphknotenmetastasen in Schildwächterlymphknoten | | (p)N1(sn) | Befall des (der) Schildwächterlymphknoten |

Quelle: TNM Classification of Malignant Tumours, 8th edition

Zusatz (i+), (mol+)

| Ausprägung | Beschreibung | | ---------- | ------------ | | (p)N0 | Histologisch keine Lymphknotenmetastasen, keine Untersuchung zum Nachweis isolierter Tumorzellen | | (p)N0(i–) | Histologisch keine Lymphknotenmetastasen, kein morphologischer Nachweis von isolierten Tumorzellen | | (p)N0(i+) | Histologisch keine Lymphknotenmetastasen, morphologischer Nachweis von isolierten Tumorzellen | | (p)N0(mol–) | Histologisch keine Lymphknotenmetastasen, kein nichtmorphologischer Nachweis von isolierten Tumorzellen | | (p)N0(mol+)| Histologisch keine Lymphknotenmetastasen, nicht-morphologischer Nachweis von isolierten Tumorzellen |

Quelle: TNM Classification of Malignant Tumours, 8th edition

Wohnort bei Diagnose

Angegeben ist hier der Wohnort zum Zeitpunkt der Diagnosestellung auf Basis des Amtlichen Gemeindeschlüssels (AGS). Verwendet werden die ersten 5 Ziffern des AGS, was der Landkreisebene entspricht. In Abwandlung der amtlichen Daten sind in der Liste alle Regionen konsistent als 5-Steller kodiert. Konkret werden die 3-stelligen AGS der Regierungsbezirke um 99 ergänzt, die 2-stelligen AGS der Bundesländer um 099.

Klassifikationen/landkreis.csv

Quelle: angepasste Auflistung auf Basis von Daten des Bundesamtes für Kartographie und Geodäsie BKG. Abruf der amtlichen Daten: link. Datenstand: 31.12.2019

| Ausprägung | Beschreibung | | ---------- | ------------ | | RS | erste 5 Ziffern des AGS, tlw. umkodiert | | GEN | Geografischer Name | | NUTS | Europäischer Statistikschlüssel | | WSK | Datum der Wirksamkeit |

Beispieldaten

In diesem Repository soll der Bereitstellungsprozess für klinische Daten veranschaulicht werden.

Zum einen ist ein XML-Rohdatensatz hinterlegt für die Lieferung der Daten aus den klinischen Krebsregistern der Länder. Dieser entspricht den gemeinsam erarbeiteten Vorgaben des oBDS-RKI und wird im ZfKD zu einem deutschlandweiten Gesamtdatensatz verarbeitet. Der "rohe" Datensatz bestehend aus XML-Daten und bildet den Ausgangspunkt der weiteren Verarbeitung, wird aber vom ZfKD nicht ausgegeben.

Zum anderen wird hier simuliert, wie eine definierte Teilmenge des verarbeiteten Gesamtdatensatzes auf Antrag übermittelt wird. Zur Veranschaulichung dieser Datenbereitstellung dient der Ordner Beispieldaten/csv. Werden im Rahmen einer Antragsverfahren im ZfKD Daten übermittelt, entsprechen diese in Form und Aufbau exakt den hier abgelegten Beispieldateien. Die csv-Dateien in diesem Ordner sind aus dem XML-Rohdatensatz generiert.

Dabei ist zu beachten, dass aufgrund der vielfältigen Beziehungen der Bestandteile im Datenschema die Integration in eine einzelne Tabelle / Datei meist nicht zielführend ist. Es werden daher die angefragten Entitäten als einzelne Tabellen / Dateien exportiert. Die hier verwendeten Identifikatoren können in einem relationalen Modell wieder korrekt zusammengeführt werden (so sind etwa Einträge der Tumortabelle den jeweiligen Patienten zuordenbar). Hilfestellung bei den relationalen Beziehungen bietet das angehangene ER-Modell, als strukturiertes Konzept zur Darstellung und Analyse von Daten in einer Datenbank.

💡 Die in den Beispieldateien hinterlegten Daten sind künstlich erzeugt, folgen einfachen Verteilungen und berücksichtigen keine medizinischen Zusammenhänge. Die Identifikatoren sind zufällig erzeugt. Es besteht daher keinerlei Verbindung zu realen Daten.

| Datei | Beschreibung | Download | | ----- | ------------ | -------- | | Rohdatensatz | Ein einfacher Testdatensatz als .xml-Datei, bestehend aus Angaben zu 30 fiktiven Patienten. | 💾 | | Applikationsart | Angaben zu Applikationsarten als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Bestrahlung. | 💾 | | Bestrahlung | Angaben zu Bestrahlungen als .csv Testdatensatz mit Referenz auf ST. | 💾 | | FM | Angaben zu Fernmetastasen (Tumor) als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Tumor. | 💾 | | Folgeereignis FM | Angaben zu Fernmetastasen als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Folgeereignis. | 💾 | | Folgeereignis Weitere Klassifikationen | Angaben zu Weitere Klassifikationen als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Folgeereignis. | 💾 | | Folgeereignis | Angaben zu Folgeereignissen als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Tumor. | 💾 | | OP | Angaben zu Operationen als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Tumor. | 💾 | | OPS | Angaben zu OP-Kodes als .csv Testdatensatz mit Referenz auf OP. | 💾 | | Patient | Angaben zu Patienten als .csv Testdatensatz. | 💾 | | Protokoll | Angaben zu Therapieprotokollen als .csv Testdatensatz mit Referenz auf SYST. | 💾 | | ST | Angaben zu Strahlentherapien als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Tumor. | 💾 | | Substanz | Angaben zu Substanzen als .csv Testdatensatz mit Referenz auf SYST. | 💾 | | SYST | Angaben zu systemischen Therapien als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Tumor. | 💾 | | Todesursache | Angaben zu Todesursachen als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Patient. | 💾 | | Tumor | Angaben zu Tumoren als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Patient. | 💾 | | Weitere Klassifikationen | Angaben zu Weitere Klassifikationen als .csv Testdatensatz mit Referenz auf Tumor. | 💾 |

Metadaten

Zur Erhöhung der Auffindbarkeit sind die bereitgestellten Daten mit Metadaten beschrieben. Über GitHub Actions werden Metadaten an die entsprechenden Plattformen verteilt. Für jede Plattform existiert eine spezifische Metadatendatei, diese sind im Metadatenordner hinterlegt:

Metadaten/

Versionierung und DOI-Vergabe erfolgt über Zenodo.org. Die für den Import in Zenodo bereitgestellten Metadaten sind in der zenodo.json hinterlegt. Die Dokumentation der einzelnen Metadatenvariablen ist unter https://developers.zenodo.org/#representation nachlesbar.

Metadaten/zenodo.json

In der zenodo.json ist neben dem Publikationsdatum ("publication_date") auch der Datenstand in folgendem Format enthalten (Beispiel):

"dates": [ { "start": "2023-09-11T15:00:21+02:00", "end": "2023-09-11T15:00:21+02:00", "type": "Collected", "description": "Date when the Dataset was created" } ],

Hinweise zur Nachnutzung der Daten

Offene Forschungsdaten des RKI werden auf Zenodo.org, GitHub.com, OpenCoDE und Edoc.rki.de bereitgestellt:

• https://zenodo.org/communities/robertkochinstitut
  
• https://github.com/robert-koch-institut
  
• https://gitlab.opencode.de/robert-koch-institut
  
• https://edoc.rki.de/
  

Lizenz

Der Datensatz "Bundesweiter klinischer Krebsregisterdatensatz - Datenschema und Klassifikationen" ist lizenziert unter der Creative Commons Namensnennung 4.0 International Public License | CC-BY 4.0 International.

Die im Datensatz bereitgestellten Daten sind, unter Bedingung der Namensnennung des Robert Koch-Instituts als Quelle, frei verfügbar. Das bedeutet, jede Person hat das Recht die Daten zu verarbeiten und zu verändern, Derivate des Datensatzes zu erstellen und sie für kommerzielle und nicht kommerzielle Zwecke zu nutzen. Weitere Informationen zur Lizenz finden sich in der LICENSE bzw. LIZENZ Datei des Datensatzes.
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