https://github.com/ajpelu/famexplorer

https://github.com/ajpelu/famexplorer

Keywords

Repository

README.Rmd

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output: github_document
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```{r, include = FALSE}
knitr::opts_chunk$set(
  collapse = TRUE,
  comment = "#>",
  fig.path = "man/figures/README-",
  out.width = "100%"
)
```

# famexploreR 


[![Project Status: Active – The project has reached a stable, usable
state and is being actively
developed.](https://www.repostatus.org/badges/latest/active.svg)](https://www.repostatus.org/#active)
[![License: GPL
v3](https://img.shields.io/badge/License-GPLv3-blue.svg)](https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0)
[![DOI](https://zenodo.org/badge/687428478.svg)](https://doi.org/10.5281/zenodo.13952463)


[famexploreR](https://ajpelu.github.io/famexploreR/) es un flujo de trabajo pensado para facilitar del seguimiento de flora amenazada por parte del personal técnico de la administración, así como la gestión de la información recopilada en campo y la generación de diversos informes a partir de dicha información. 

El flujo de trabajo está compuesto por funciones específicas desarrolladas en R y una aplicación desarrollada con shiny. La aplicación permite el cómputo de diferentes variables e índices (riqueza y diversidad vegetal; análisis de vecindad; exploración de rasgos biológicos y reproductivos), así como la visualización espacial de los datos de seguimiento. El formato modular de famexploreR permite incorporar nuevos módulos en función de las necesidades demandadas por los técnicos y gestores encargados de la conservación. 

La aplicación permite que técnicos y agentes de medio ambiente, sin necesidad de conocimientos específicos de estadística o programación, puedan generar de manera rápida y sencilla gráficos e informes de los seguimientos de las especies amenazadas, que pueden ser utilizados para planificar actuaciones de gestión. 


## Instalación 

Puedes instalar la versión de desarrollo de famexploreR desde GitHub con el siguiente código:

``` r
# install.packages("devtools")
devtools::install_github("ajpelu/famexploreR")
```

**famexploreR** fue construido en [R](https://www.r-project.org), un lenguaje de programación de código abierto, utilizando el paquete [Shiny](https://shiny.rstudio.com), un marco de aplicación web para R.

Puedes descargar la versión de desarrollo de **famexploreR** desde [GitHub](https://github.com/ajpelu/famexploreR).


## Cómo ejecutar famexploreR

La opción recomendada para utilizar la aplicación es descargar el paquete y ejecutarlo localmente. 

### Localmente

1. Se recomienda el uso de Rstudio.

2. Descarga e instala el paquete `famexploreR` usando:

``` r
# install.packages("devtools")
devtools::install_github("ajpelu/famexploreR")
```

3. Ejecuta la aplicación:

```r
library("famexploreR")
launch_famexplorer()
```

### Live 

También se puede instalar el paquete en un servidor que contenga R-studio y shiny. De forma provisional se muestra un ejemplo [aquí](http://vlab.iecolab.es/ajpelu/famexploreR/)

Todo el código necesario se encuentra en este [repositorio](https://github.com/ajpelu/famexploreR)

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