genome_tracks
A Snakemake workflow and MrBiomics module for easy visualization of genome browser tracks of aligned BAM files (e.g., RNA-seq, ATAC-seq, scRNA-seq, ...) powered by the wrapper gtracks for the package pyGenomeTracks, and IGV-reports.
https://github.com/astorfi/cnn-lstm-bilstm-deepcnn-clstm-in-pytorch
In pytorch Learing Neural Networks likes CNN(Convolutional Neural Networks for Sentence Classification (Y.Kim, EMNLP 2014) 、LSTM、BiLSTM、DeepCNN 、CLSTM、CNN and LSTM
sars-cov-2-sequenzdaten_aus_deutschland
Ein zentraler Bestandteil einer erfolgreichen Erregersurveillance ist das Verständnis der Verbreitung eines Erregers sowie seiner pathogenen Eigenschaften. Hierbei stellt das Wissen über das Erregergenom eine wichtige Informationsquelle dar. So erlaubt der Nachweis von Mutationen im Genom eines Erregers, Verwandtschaftsbeziehungen zu rekonstruie...
abwassersurveillance_amelag_-_wochenbericht
Im Rahmen des Vorhabens „Abwassermonitoring für die epidemiologische Lagebewertung“ (AMELAG) wird in Deutschland das Abwasser von ausgewählten Kläranlagen auf verschiedene Krankheitserreger untersucht. Der folgende Bericht präsentiert die vergangenen und aktuellen Ergebnisse und Entwicklungen dieser Untersuchungen.
thebest
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https://github.com/bamresearch/parallel-abus
This code is a Python implementation of the parallelized adaptive Bayesian Updating with Structural reliabilty methods.
https://github.com/bamresearch/b-least-analysis
Calibration tool for measurement data with ISO 6143-based model fitting and uncertainty estimation.
3dentification
Identifying 3D printing specific plastic types and colors using Near-Infrared Spectroscopy and Computer Vision.